জনস্বাস্থ্য প্রকৌশল অধিদপ্তর একটি নির্দিষ্ট ভিশন ও মিশন সামনে রেখে কাজ করে যাচ্ছে:
ভিশন:
- নিরাপদ সুপেয় পানি সরবরাহ ও স্যানিটেশন সুবিধা নিশ্চিতকরণের মাধ্যমে জনসাধারনের জীবনযাত্রার মান উন্নয়ন করা
মিশন:
- পল্লী ও শহরাঞ্চলের (ওয়াসার আওতাধীন এলাকা ব্যতীত) সকল জনগণের জন্য নিরাপদ সুপেয় পানি সরবরাহ ও স্বাস্থ্য সম্মত স্যানিটেশন ব্যবস্থা নিশ্চিত করা
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস